女性卵巢囊腫一般不嚴重，卵巢囊腫多數為良性病變或生理性改變，通常不會惡變。如果卵巢囊腫體積較大，尤其是囊內出現乳頭或囊壁不均質增厚，會增加惡性病變的可能，需要及時手術治療，通過術後病理檢測，明確診斷良、惡性。卵巢囊腫大部分是良性腫瘤或生理性囊腫，一般囊腫直徑＜4cm，囊壁較薄，由於卵泡或黃體持續存在沒有消退導致，該情況通常不需要治療，一般1-2次月經後可自行消退。

卵巢囊腫還包括卵巢巧囊、卵巢漿液性囊腺瘤、黏液性囊腺瘤等卵巢腫瘤，一般為良性腫瘤，但需要手術治療，可進行腹腔鏡下卵巢囊腫剝出。如果為惡性病變腫瘤，則需及時進行手術治療。