大部分卵巢囊腫不會影響月經，個別情況下卵巢囊腫較大，會影響卵巢的功能或卵巢囊腫本身有分泌雌、孕激素的功能，影響月經，但相對少見。

大部分卵巢囊腫無功能，卵巢囊腫體積較小，對卵巢功能本身沒有影響，不會改變月經，引起月經紊亂，通常經B超檢查或查體檢查偶然發現。一部分卵巢囊腫體積較大，壓迫卵巢，造成卵巢功能改變或囊腫本身分泌一定量的雌、孕激素，造成月經改變，有時會表現為各種形式的月經紊亂。B超檢查如果提示有大的卵巢囊腫，需要及時行手術治療，術後要送病理學檢測，以明確診斷。

卵巢囊腫包括很多類型，其中最常見的卵巢囊腫是功能性卵巢囊腫，即卵巢黃體囊腫或濾泡囊腫，稱為生理性卵巢囊腫。一般直徑為3-4cm，囊壁較薄，可以自行消退，不需要任何治療，沒有任何臨床症狀。