卵巢囊腫吃何種藥好，需根據囊腫性質而定。因為卵巢囊腫比較寬泛，種類較多，若是生理性囊腫，無需吃藥。若是惡性腫瘤，吃藥並無較大作用，需儘快手術。大部分良性腫瘤吃藥並無作用，只有巧克力囊腫即子宮內膜異位症囊腫，與每月來月經有關，此時服用高效孕激素或避孕藥，對囊腫進展有所抑制。

所以大部分卵巢囊腫不用吃藥，除巧克力囊腫通過服藥可控制囊腫進展外，惡性囊腫應儘快手術，生理性囊腫通過觀察可自行消退。