男子精子畸形率高懷孕了，對胚胎沒有任何的影響，對患者的健康也不會造成任何的損害。畸形率高多提示存在有缺陷的精子，有缺陷的精子是不能夠與卵子結合的，只有正常健康的精子才可與卵子結合。

正常男性含有將近2億精子，其中可能存在有畸形的精子，它們在受精的過程中會被自然淘汰，女性在排卵期只有一個卵子排出，只有正常健康的精子才能順利地與卵子相結合，這是一個優勝劣汰的過程，而畸形的精子在此過程中會被完全淘汰，不會與卵子發生精卵結合反應而導致形成受精卵，進而發育成胚胎。

所以畸形率高的精液，如果懷孕，一定是正常的精子與卵子發生精卵結合形成了健康的胚胎，不會對身體和胚胎有任何的影響。