克羅恩病的好發部位是小腸和大腸，尤其是在回盲部比較多見，另外可以在肛門出現病變，直腸和肛周出現出現病變，克羅恩病的特點分析如下：

1、節段性分佈：在整個消化道都會出現病變，包括口腔、食管、胃、十二指腸到小腸、大腸、肛門、直腸，整個消化道都可以出現病變，是與潰瘍性結腸炎很大的區別，潰瘍性體腸炎僅影響大腸，不影響小腸，更不會影響食管、胃、十二指腸，克羅恩病會影響整個消化道，最常見的好發部位是回盲部，在結腸其他部位也可以有；

2、跳躍性分佈：可能病變累及胃，逐漸累及到食管、小腸、大腸，但是受累部位中間的腸道，可能為正常；

3、縱行潰瘍：潰瘍形態和潰瘍性腸炎的病變或腸結核的病變不相同，是縱行，沿著腸管長軸分佈的潰瘍。