交界性卵巢腫瘤容易復發，如果為漿液性交界性腫瘤，複發率在50%以上，可能左側長完右側還會再長，或沒有剔除乾淨出現復發。如果交界性黏液腺瘤未剔除乾淨，大概率會出現復發現象，如果想減少復發，需要將瘤體周圍全部切除。

交界性卵巢腫瘤通常見於30-40歲的女性，患者比較年輕，如果切除過於乾淨，相當於將兩側卵巢全切，則發生癌變的機會減少，但可能導致患者更年期提前，且更年期症狀有所加重。激素水平從較高水平陡然下降，可能造成情緒以及心血管系統、內分泌系統異常。因此，不建議過早將兩側卵巢與輸卵管切除，如果疾病出現復發，可以進行二次手術治療。