卵巢腫瘤分類較複雜，根據世界衛生組織2014版女性生殖器官腫瘤的分類，卵巢腫瘤約分為14類，其中較常見的是卵巢上皮性腫瘤、生殖細胞腫瘤、性索間質細胞腫瘤及轉移而來的腫瘤。

其中主要是上皮性腫瘤，約佔50％-70％，可分為良性及惡性，有良性的上皮性漿液性腫瘤及黏液性腫瘤，惡性也分漿液性和黏液性；生殖細胞腫瘤約佔20％-40％，較常見的是畸胎瘤、無性細胞腫瘤等；性索間質細胞腫瘤約佔5％-7％，其餘的是一些來自胃腸道或其它器官轉移的腫瘤。