良惡性畸胎瘤可通過以下方面進行鑑別：

1、性質：良性畸胎瘤多為囊性，含有多種成分，包括皮膚、毛髮、牙齒、骨骼、油脂、神經組織等，腫瘤內可見皮膚及其附件，軟骨、呼吸道、消化道的上皮及神經組織等。惡性畸胎瘤多為實性，腫瘤由分化不成熟的胚胎樣組織組成，常有分化不良、神經外胚層成分的分化欠佳，沒有或少有成形組織，結構不清楚；

2、影像學：良性畸胎瘤X線檢查可見異常鈣化，如牙齒或異常骨骼等；

3、其他方面：良性畸胎瘤不轉移並預後好，惡性畸胎瘤可發生多發轉移。

畸胎瘤在卵巢生殖細胞腫瘤中常見，來源於生殖細胞，分為成熟畸胎瘤與未成熟畸胎瘤，成熟畸胎瘤即良性畸胎瘤，未成熟畸胎瘤為惡性畸胎瘤。