小兒厭食症的診斷主要從症狀上來鑑別，一般厭食症孩子比較瘦弱、矮小、面色萎黃、肚腹脹大、四肢瘦弱，這是從外形上來看。

從飲食上來看，孩子不喜歡吃飯，什麼東西都吃不進去。無論是什麼樣的飲食，做的再好吃也不想吃，食量很小。有的孩子吃完了飯就要去大便，有的孩子好幾天一次大便，一般從臨床上對厭食症的診斷即從上述臨床表現判定。