子宮內膜異位症做完手術之後還會復發，而且復發的可能性比較大，做手術時醫生可能就會告訴你，子宮內膜異位症是長期慢性的疾病，不是做一次手術就能解決問題。術後會有長期的用藥或者隨訪過程，以後很可能會復發，而且在某一個特定的時期，它還有可能發生惡變，所以子宮內膜異位症是很令人煩惱的疾病，會有長期的隨訪過程。但是確實有一部分人做完卵巢囊腫，比如巧克力囊腫這一類的子宮內膜異位症，可能過7-8年之後才復發，或者一直就沒有復發。

子宮內膜異位症做完手術之後，復發的可能還是比其它的囊腫大比較多，術後可能需要用藥物來抑制其復發，或者半年後懷孕。因為懷孕加哺乳有將近兩年的時間不來月經，對於抑制子宮內膜異位症病灶的復發比較有好處，而且做完手術之後盆腔環境得到改善，懷孕幾率也會大幅度增高。如果得了子宮內膜異位症需要做手術，也有懷孕打算的人，一般推薦做完手術之後半年之內去懷孕。已經沒有生育要求的子宮內膜異位症患者，做完手術之後，需要用藥物去抑制其復發。