子宮內膜異位症和不孕症之間有一定相關性，50%的子宮內膜異位症患者，可能合併有不孕症。子宮內膜異位會造成輸卵管拾卵功能下降或盆腔生物環境較差，有大量炎症因子，將卵母細胞殺滅，不容易懷孕。患者需要根據患者子宮內膜異位症的分期及嚴重程度，來判斷選擇適合受孕的方式。一般Ⅰ期或Ⅱ期患者，有可能自然受孕，Ⅲ期或Ⅳ期患者，需要通過人工助孕的方式來懷孕。