毛囊炎和皰疹的區別如下：

1、致病原因不一樣。毛囊炎是由於機體免疫力下降，細菌感染引起的，多為痤瘡丙酸桿菌感染。皰疹是由於機體免疫力下降，病毒感染，病毒多為單純皰疹病毒或者水痘-帶狀皰疹病毒。

2、在臨床治療上不一樣。毛囊炎的治療可以應用抗菌消炎的藥物，比如外用藥選擇克林黴素磷酸酯凝膠、複方多粘菌素B軟膏、夫西地痠軟膏、氧氟沙星凝膠，口服藥可以選擇多西環素膠囊或者美滿黴素膠囊。皰疹的治療需要外用阿昔洛韋軟膏，如果疼痛比較劇烈，還可以應用辣椒鹼軟膏，並且服鹽酸伐昔洛韋片或者泛昔洛韋片治療。