正常女性陰蒂非常敏感，而且陰蒂外有陰蒂包皮覆蓋。如果存在解剖學異常，如陰蒂包皮過短、陰蒂裸露，或者存在一些手術的原因造成創傷、解剖學變異，可能會發生摩擦、疼痛。

還有一部分人陰蒂外觀看起來完全正常，但由於神經分佈的不同或其它問題，病人會出現灼痛、燒痛的感覺，也會出現陰蒂疼痛。

總體而言，陰蒂疼痛通常由於解剖學異常或神經異常導致。但對於陰蒂疼痛應該首先明確原因，然後對因治療。