對於嬰兒大腦發育不良的治療，要具體情況具體分析，應先分析導致其出現大腦發育不良的原因，再採取相應措施，具體如下：

1、腦癱：此時大腦發育不良並非進行性病變，所以治療上通常主要採取康復訓練，先對嬰兒整個神經系統進行詳細評估，從而針對性進行康復訓練。此外可以配合藥物以及特殊的生物治療，通過上述康復訓練、藥物和生物治療，嬰兒的腦功能會逐漸得到改善；

2、先天性腦積水：需要及時領嬰兒到腦外科就診，查頭部CT或者核磁共振明確診斷，如果病情需要的情況下，需要到腦外科進行手術治療。當腦積水得到緩解後，再對於嬰兒的大腦功能進行相應的康復訓練，其功能會逐漸追趕達到正常孩子或接近正常孩子的水平；

3、先天性遺傳代謝疾病：此時沒有特效的治療方法，主要是對症進行康復訓練。