如果發現腦發育不良，應及時治療，而且越早發現和治療效果越好。通常建議在患兒1-2歲內治療，而且應採取藥物、康復等綜合治療的方法。因為腦發育較快的階段是2-3歲，4-6歲後發育會越逐漸減少、減慢，一旦腦發育停止再進行治療，則效果較差，所以應及時進行治療。

如果患兒是1歲之內發現腦發育不良，而且也不嚴重，則多數患兒可以治癒。如果患兒在3-4歲，出現智力落後、行走困難等，則治癒變得較為困難。