尿道下裂術後小便疼痛常見原因如下：

1、局部炎症感染，主要指外麵包皮是否有感染導致刺激；

2、尿道通暢性問題，小便是否有費力感、梗阻感，尿線是否細，需要排除尿道梗阻情況，如果持續存在尿道狹窄，必然會出現小便費力、疼痛等情況；

3、尿瘻，如果新鮮創口出現疼痛，如導尿管拔除以後出現小便疼痛，尤其是出現排尿費力或者會陰部腫脹，建議馬上到就近醫院泌尿外科進行專業處理，必要時重新留置一根導尿管，因為有可能會引起嚴重問題。