矮小症病因複雜，需要進行的檢查較多，一般有以下幾種：

1、明確病因，最早需要進行骨齡檢查，觀察骨齡是否落後，需要明確是否存在矮小家族情況或生長激素缺乏情況；

2、需要進行內分泌激素水平檢查，包括生長激素激發試驗，觀察生長激素是否缺乏；

3、甲狀腺功能檢查，明確是否由甲狀腺功能低下導致；

4、電解質檢查，是否存在腎臟方面疾病導致矮小；

5、需要進行垂體相應檢查，核磁共振觀察是否垂體分泌方面導致矮小。