導致非垂體性矮小症原因有很多，包括遺傳代謝性疾病、先天性骨骼發育障礙、染色體異常，包括早產兒或者是孩子出生時候體重身長就很小，即宮內發育遲緩，出生以後追趕生長不足，或者兒童本身患有慢性系統性疾病，先天性心臟病、肝腎功能障礙、消化系統疾病等。包括各種原因導致長期營養不良，甲狀腺激素缺乏，甚至腫瘤或者家族性、體質性和精神心理性矮小症等，不同病因會有不同具體治療方案，具體如下：
1、目前針對矮小症藥物治療，主要是注射用基因重組人生長激素，且至少是要持續用藥1-2年，因為身材增長需要一定時間，短時間內無法快速生長，早發現，早診斷，早治療，才能更好改善最終成年身高；
2、培養孩子良好的生活習慣，規律作息，積極的防治營養性的疾病
3、提供營養豐富、均衡膳食，避免過多食用甜食、飲料、油炸食品，適當控制體重；
4、督促兒童進行戶外活動，體格鍛鍊，有利於骨骼生長；
5、保證兒童足夠睡眠時間，並保持心情愉悅。