直腸鏡檢查主要是檢查肛門以及直腸部位有無異常病變，如息肉、潰瘍、腫瘤等。直腸鏡為較硬、呈鋼管樣結構，長度約20cm，檢查時需要將肛門擴開，將直腸鏡深入直腸部分，會存在一定不適感。如果對肛門擴開過程能夠很好耐受，無明顯痛苦。若合併肛裂、痔瘡、肛周膿腫、肛門直腸癌或對肛門擴開十分敏感者，可以存在明顯疼痛以及不適，但一般在能夠接受的範圍內。

為了緩解直腸鏡檢查時所帶來的痛苦，患者應該在檢查前排淨大便，並在檢查過程中儘量保持肛門放鬆。女性在做直腸鏡檢查時應避開月經期，存在肛門狹窄症狀不適合進行直腸鏡檢查，但患者可以採用麻醉無痛腸鏡檢查進行替代。