一般懷孕前3個月易發生自然流產，自然流產指未經人為干預而發生，相對人工流產而言。自然流產原因有胚胎因素、母體因素、父親因素和環境因素等，其中胚胎因素多見。由於精子或卵子染色體異常，或精子和卵子形成受精卵後，受精卵在分裂過程中出現染色體變異，而導致自然流產。另外，母體內分泌異常亦可導致自然流產，亦有可能孕婦情緒不穩定、生活不規律、劇烈運動或腹部受撞擊等外在因素而導致自然流產。

由於前3個月內胚胎還沒有形成，此時胚胎不穩定，易出現先兆流產或發生自然流產，所以懷孕後需注意避免性生活及劇烈運動，一般懷孕6周行B超檢查，從而證明是宮內孕還是宮外孕。懷孕9-10周再次行B超檢查，觀察胚胎髮育情況及胎心、胎芽，從而發現胎停育(胎兒停育)。若出現腹痛或陰道出血，需隨時到醫院檢查處理。