發生自然流產時，需前往醫院進行檢查，排查妊娠物是否已經排出，如果沒有排出，可能需進行清宮手術操作。主要的妊娠物排出後，需在流產後2周再次前往醫院複查，確保所有妊娠物已排出宮腔。同時流產後需注意休息，避免過於勞累，出血乾淨前避免同房。

對於單發的一次流產，一般不建議患者進行大規模的流產病因篩查，但如果已經發生2次或2次以上的自然流產，建議患者在月經恢復後，到醫院進行流產病因學篩查。包括女性內分泌檢查、凝血機制檢查，以及特殊免疫檢查。同時也建議男性到醫院進行精液常規檢查，包括精子畸形率檢查，都可能發現導致反覆發生自然流產的病因。