判斷自然流產是否乾淨，可以通過臨床的症狀，但是最準確的方法還是流產後的B超檢查。自然流產後如果流產比較乾淨，一般可以觀察自然流產之後排出的胚胎組織，如果胎囊比較完整且可以看到比較完整的絨毛，提示流產比較乾淨，稱之為完全的自然流產。同時如果自然流產比較乾淨，陰道出血量也逐漸減少，同時腹痛的症狀也會明顯減輕。

但單純靠症狀並非100%準確，比較準確的方法還是流產後2周左右到醫院做經陰道的婦科B超，通過B超可以明確的判斷，宮腔內是否仍有殘留的胚胎組織以及是否存在積血，可以判斷自然流產是否已經乾淨。同時對於流產後下次的備孕工作，建議如果是35歲以下患者且若是第一次自然流產，通常避孕3個月後可以嘗試再次懷孕。但患者如果有2次或者2次以上自然流產病史或35歲以上的自然流產，建議去醫院的生殖中心做全面檢查，查找自然流產的原因之後再進行下一步的備孕工作。