臨床通常需要從臨床表現上判斷自然流產是否流乾淨。自然流產出血時間較人工流產長，但多數出血時間是在2-3周，隨後逐漸地減少，直到完全停止。如果陰道出血時間持續3周以上，或出血量減少後又出現增多，要考慮可能是流產不全的現象。

另外，無論自然流產還是人工流產，均建議在流產後2周進行常規的超聲檢查，避免繼發感染以及繼發陰道大出血。超聲檢查可以直觀地瞭解宮腔內是否有胚胎或蛻膜組織物殘留，若流產2周後宮腔內仍然有組織殘留物，可以採用藥物促進子宮收縮，幫助排出組織殘留物，也可以進行清宮手術徹底治療。