沒有併發症的自然流產，通常不會影響之後的懷孕。但有時自然流產也會有併發症，比如流產後感染，如果未及時發現、及時治療，則有可能影響之後的懷孕。自然流產有時與媽媽的自身因素相關，比如抗磷脂綜合徵，在下次妊娠時需要給予抗凝治療。如果沒有處理，可能會增加下次妊娠繼續流產的概率。

對於一次自然流產通常不需要特殊處理，只要恢復正常、沒有感染即可。但如果術後出現腹痛、發熱等特殊情況，一定要及時做B超檢查以及婦科檢查。如果B超檢查沒有異常，但婦科檢查發現子宮壓痛、附件區增厚、壓痛，則是術後感染的特異表現，需要給予抗生素進行抗感染治療。

如果抗感染治療不及時，有時會損傷輸卵管，造成輸卵管阻塞，影響以後的生育功能。對於自然流產比較少見，如果連續2次以上自然流產，則需要查找原因，除外抗磷脂綜合徵等特異性疾病。