手足口病的隔離期通常為7-10天，需待孩子體溫完全正常，手部、腳部、身體的皮疹完全消退後，方可解除隔離。手足口病屬於傳染性疾病，主要通過腸道病毒感染所致，比如柯薩奇病毒、腸道病毒71型(EV71)。

此病主要通過呼吸道傳播，尤其是打噴嚏、咳嗽等飛沫傳播。因此，在手足口病未完全痊癒前，應避免去幼兒園或小學，防止導致其他同學感染。此外，密切接觸也會傳染手足口病，比如患有手足口病的小朋友接觸玩具後，健康的小朋友再次接觸這類被汙染的玩具，可導致手足口病的傳播。