手足口病痊癒不能單純從皰疹消失而下結論。手足口病從咽部發現紅點、皰疹到手腳、膝蓋、肛周出現皰疹，整個過程可能會持續3-7天。一般第2周開始咽部皰疹會消失，但手腳皰疹會出現脫皮現象。

皰疹未必能存在很長時間，一定要在7-14天隔離期結束才可以認為痊癒，而且這時候也是預防或傳播關鍵時期，不能說皰疹消失即痊癒，這時患兒接觸其他寶寶仍然會有傳染性。