手足口病以發燒為前期症狀，所以寶寶會出現高燒，可伴隨驚厥，特別是5歲以下的小寶寶，高熱合並驚厥發生率比較高，需引起注意。另外一種情況是重症型手足口病，會出現腦炎症狀，神經症狀引起抽搐，抽搐可能會反覆，持續時間比較長。

如果是高熱、驚厥，抽搐一般呈一過性，只要控制體溫即可。對於重症型手足口病出現抽搐，要足夠重視。如果出現抽搐，主要從臨床表現可以看出是高熱驚厥引起還是腦炎引起。若為高熱驚厥引起抽搐，會有四肢厥冷，甚至部分寶寶會出現口吐白沫情況。重症型手足口病引起併發症，如腦炎引起抽搐，常呈強直性抽搐，而且不容易緩解。