電子胃十二指腸鏡已替代纖維胃腸鏡，且具有圖像清晰、可進行放大、染色等操作等優點，而電子胃十二指腸鏡在經過咽部時，患者會因咽部出現的異物感導致噁心等反應，而不會有較大的疼痛，同時也與患者的敏感度強弱有關，若患者較為敏感，則對胃鏡的接受程度較差，目前可通過對患者進行靜脈輸入淺麻醉藥物，在睡眠中完成檢查和治療。