先天性無精子症的概念較模糊，一般認為是非後天因素所致的無精子症。某些先天性無精子症可以達到治癒，大部分無精子症患者治癒的希望仍相對較小，具體如下：

1、克氏綜合徵患者，由於染色體異常導致的無精子症，通過睪丸顯微取精技術，約有50%-60%的患者可找到精子，進行二代或三代試管嬰兒，使女方受孕。隱睪患者以及AZFc、AZFd缺失患者，進行睪丸顯微取精，獲得精子的概率約為50%-60%。如果有精子，做試管嬰兒可妊娠；

2、低促性腺激素性性腺功能減退，內分泌表現為FSH和LH較低，如果排除垂體病變，給予患者長期應用HCG加HMG，約1年以上，部分患者會有較好的治療效果，可直接在精液內找到精子，然後通過二代試管嬰兒技術使女方受孕，屬於可治療範圍。