少精子症一般在臨床的治療手段比較多，精子的產生需要激素內分泌進行調控。通過給予患者一定激素來調控患者的雄激素水平，可以刺激睪丸產生精子，從而可以使患者的精子數量在短時間內儘量達到正常受孕的水平，因此可以通過這種方式治療少精子症的患者。

但也有部分患者屬於頑固性少弱畸精症，給予所有的治療方案可能都無法達到自然受孕。此時只能通過試管嬰兒的方式，通過在精液裡面挑選相對比較優質的精子，在胚胎實驗室進行ICSI授精，讓患者通過試管嬰兒輔助生殖的方式生育健康的子代。