非梗阻性無精症的危害與病因有關，具體如下：

1、隱睪導致非梗阻性無精症：指陰囊空虛，檢查是不能捫及睪丸，危害為：睪丸長期在盆腔或腹腔內停留，可引起睪丸生精功能下降，並可誘發睪丸惡變造成睪丸癌，因此患者2歲之前，建議做睪丸下降術或睪丸固定術；

2、Y染色體基因缺失導致非梗阻性無精症：如Y染色體C缺失，患者精液中可出現極少量精子，或通過顯微外科手術獲得精子，如通過輔助生殖技術生育男孩，Y染色體基因缺失可遺傳給下一代，造成無精症或不孕不育症，建議患者藉助第三代試管嬰兒技術助孕。