艾滋病在臨床症狀和反應上，並無性別區別，即女性艾滋病，臨床症狀和其他男性相同。主要反應是發熱、消瘦、腹瀉，以及全身淋巴結腫大，同時伴有機會性感染和機會性腫瘤。機會性腫瘤，如淋巴瘤在結核病患者中發病率較高，某些少見腫瘤，如卡波西肉瘤較容易出現於艾滋病患者。

在發熱、消瘦的同時，存在各種機會性感染，常見感染部位是呼吸道。呼吸道可以有結核菌感染而出現肺部結核，有隱球菌感染而出現肺部隱球菌病。其他真菌疾病，也會有肺部細菌、病毒感染，如鉅細胞病毒性肺炎，以及各種細菌導致肺炎。

有真菌、結核菌，以及病毒和細菌導致的中樞神經系統感染，以及特殊病原體如弓形蟲等導致神經系統感染。全身其他部位感染，還包括泌尿系統、腸道病原菌感染。真菌可以導致真菌性食道炎，以及皮膚、黏膜感染。