結核性腹膜炎最常見或嚴重的併發症主要是三個，具體如下：
1、腸梗阻：腸結核發生之後會造成收縮，隨著時間延長會收縮，收縮之後能夠使得腸腔變的狹窄，輕者造成不全性梗阻，嚴重者造成完全性梗阻，一旦出現腸梗阻腸子就不通，腸道內容物就不能從上面通到下邊，這就造成阻塞，會引起劇烈的腹痛等；
2、腸穿孔：腸結核長在腸壁上，如果結核比較深、比較大，完全可以造成腸子破裂、穿孔。一旦穿孔之後，內容物如糞便、氣體，完全可以到達腹腔，引起腹腔化膿性感染；
3、腸出血：腸黏膜的血供非常豐富，不管是腸子病變或造成血管破裂，都可以嚴重的造成出血。