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早期心肌炎患者可能沒有明顯症狀甚至無症狀，部分患者可能會出現心慌、心悸、胸悶、胸痛、氣短、呼吸困難、乏力，確診心肌炎可以初步做心電圖、化驗心肌酶學的化驗檢查，查看是否存在異常表現。詢問患者近3周之內有無咳嗽、咳痰、感冒、發熱、腹瀉等異常情況，根據 整體臨床症狀以及檢查，決定是否需要進一步檢查心臟彩超、血常規、胸片。
臨床引起病毒性心肌炎常見病毒為柯薩奇病毒，尤其是B組病毒，可引起呼吸道前趨症狀，部分患者初始可表現為感冒、流涕等症狀，而後出現胸悶不適等症狀。而部分患者可能前期會出現腹瀉症狀，但後面病毒會侵犯到心肌，直接對心肌造成損害，或病毒導致機體抗原免疫反應引起心肌損害，包括局灶性損害或廣泛性損害。
患者心肌炎復發的表現為自覺乏力、活動耐力下降、頭暈、頭疼，以及相關的心臟不適感，如胸悶、胸疼、心悸、心慌、心前區不適、氣促、呼吸困難等。若患者存在前驅的病毒感染史，又出現相關的心臟症狀，需警惕是否患有心肌炎或既往存在心肌炎，並且近期由於病毒感染導致心肌炎復發。此時患者可以完善相關的心肌酶學、心電圖及心臟彩超檢查，從而明確診斷。
細菌性心肌炎和病毒性心肌炎的區別是致病微生物種類不同，細菌性心肌炎常見感染病菌為念珠菌、葡萄球菌、白喉桿菌，而病毒性心肌炎一般是腺病毒感染。兩者在臨床表現上有時不好鑑別，可 通過核酸檢測病毒或血培養檢測是否有細菌或病毒感染，從病原學上加以區分。
兒童的心肌炎是一個比較常見的毛病，比較兇險，最嚴重的稱為暴發性心肌炎，需進行搶救，從發病到心跳驟停可能只需2-3天。所以，心肌炎治療要看輕重程度，暴發性心肌炎全心的炎症較嚴重，會出現明顯的血壓不穩定，嚴重時心跳驟停、暈厥 。
肌酸激酶同工酶即CKMB，主要存在於心肌，水平升高可能提示心肌損傷、心肌炎。肌酸激酶即肌肉裡的酶，包括心肌、骨骼肌內的酶。一般心肌損傷後，CKMB會釋放到血液中，幾小時後即可升高，持續3-5天。