甲狀旁腺功能減退主要會造成低鈣血癥。低鈣血癥會造成神經肌肉過度興奮，表現有自發性手足搐搦、甚至發生喉痙攣、癲癇大發作。低鈣影響自主神經功能會出現腸痙攣導致腹痛、支氣管哮喘、膽絞痛等症狀。長期低鈣血癥會造成記憶力減退、抑鬱、焦慮、精神錯亂、兒童可出現智力障礙、皮膚乾燥、脫屑、色素沉著等。做顱腦CT可發現顱內有異位鈣化灶。