目前除了異基因造血幹細胞移植，是唯一可能治癒慢性特發性骨髓纖維化的方法以外。其他藥物或方法例如雄激素、羥基脲、脾切除或者放療等都只是姑息性治療，只能改善患者的症狀。
一、藥物治療
1、雄激素及蛋白同化激素：對於不適合接受異基因造血幹細胞移植治療的慢性特發性骨髓纖維化患者應當接受姑息性治療。雄激素單藥或者聯合潑尼松治療慢性特發性骨髓纖維化的有效率約為30%~60%，主要能夠改善慢性特發性骨髓纖維化患者的貧血。患者對於不同種類的雄激素可能有不同的應答。另外，在男性患者接受雄激素治療之前應當常規接受前列腺癌的篩查。
2、沙利度胺、來那度胺：沙利度胺的作用包括消除全身症狀、縮小脾臟、改善貧血、改善白細胞和血小板數目等。單藥沙利度胺治療慢性特發性骨髓纖維化的有效率約為20%~40%，但是，多數患者不能耐受大劑量沙利度胺的副作用，例如周圍神經病變、便秘、乏力和粒細胞減少等。
3、羥基脲：羥基脲可以用於縮小脾臟大小以及降低部分慢性特發性骨髓纖維化患者的白細胞增多和血小板增多。另外，還有研究顯示羥基脲可以減輕慢性特發性骨髓纖維化患者的骨髓纖維化程度。還有研究顯示羥基脲的有效率可能與是否存在JAK2V617F突變有關，在69例CIMF患者中，有JAK2V617F突變患者的有效率為48%，而沒有突變的患者的有效率只有8%。
4、蘆可替尼：蘆可替尼在縮脾和改善骨髓纖維化有一定療效，且蘆可替尼與現有常規骨髓纖維化治療藥物相比，可顯著延長患者的總生存期。
二、手術治療
脾大是慢性特發性骨髓纖維化患者的常見表現，儘管脾切除可以改善患者的脾大相關症狀以及脾亢表現。但是脾切除術對於慢性特發性骨髓纖維化患者有著較高的手術相關死亡率以及嚴重的短期和長期併發症。脾切除術的主要併發症包括腹腔出血、膈下感染、術後血小板增高相關的血栓事件，例如卒中、肺栓塞和門靜脈血栓形成。另外，脾切除術後還會加重肝臟髓外造血，造成肝臟急劇增大和肝功能惡化，應當嚴格地挑選患者進行脾切除術。手術適應症應當限定於有以下表現的慢性特發性骨髓纖維化患者：有症狀的門脈高壓（如靜脈曲張出血、腹水），藥物難治的顯著脾腫大伴有疼痛或合併嚴重惡病質，以及依賴輸血的貧血。相反，嚴重的血小板減少是即將發生白血病轉化的標誌，切脾對此類患者的預後不會有良好的影響。
三、放射治療
放射治療可緩解肝、脾腫大所致的飽脹症狀，但症狀緩解時間較短（中位時間3～6個月）。脾區照射的總劑量為0.1～0.5Gy（分為5~10次照射）。主要不良反應是血細胞減少，由此而導致的死亡率可達10％以上。
四、其他治療
異基因造血幹細胞移植，該治療方法操作方法為先接受超大劑量放療或化療，聯合其他免疫抑制藥物，以清除體內的腫瘤細胞、異常克隆細胞。然後再回輸採自自身或他人的造血幹細胞，重建正常造血和免疫功能。雖然異基因造血幹細胞移植是目前能夠治癒慢性特發性骨髓纖維化的唯一方法，但是由於供體的來源、患者年齡的限制以及移植後併發症，例如感染等。使得只有很少數的慢性特發性骨髓纖維化患者，例如年齡小50歲的慢性特發性骨髓纖維化，有機會接受異基因造血幹細胞移植。