慢性腎盂腎炎一般沒有特徵性臨床表現，它的表現可能是病人會感覺到腰麻、腰脹、腰痛等等，如果病人出現了急性發作表現和急性腎盂腎炎差不多，另外慢性腎盂腎炎也可能會出現腎小管間質損傷的表現。
慢性腎盂腎炎和急性腎盂腎炎有區別，慢性腎盂腎炎一般沒有典型的臨床表現，病人可以表現為腰部的隱痛，或者腰麻、腰脹等症狀，而且病人往往也沒有尿頻、尿急、尿痛的症狀，但是如果慢性腎盂腎炎出現急性發作的時候，病人可以有腰痛、發熱，甚至有尿頻、尿急、尿痛，另外，就是長期的慢性腎炎可能會造成病人腎小管間質的損傷，這個時候病人會表現為夜尿增多、小分子尿，低比重尿等等。