治療便秘是消化科醫生的基本功，便秘是消化科門診經常遇到的一種情況，便秘可以分為繼發性便秘與原發性便秘。繼發性便秘是指繼發於其他疾病的便秘，針對這種情況需要積極尋找原發病，並針對原發病進行治療。原發性便秘指找不到原因的便秘，原發性便秘可以使用藥物進行治療。
對於出口梗阻型便秘需要使用生物反饋治療，針對慢傳輸型便秘可以使用促進胃腸蠕動的藥物，刺激性瀉藥、滲透性瀉藥、膨脹類瀉藥以及益生菌進行治療。近年來促分泌藥物也加入了抗便秘的藥物之列，所以出現便秘應當去醫院就診，在醫生指導之下完善檢查、明確診斷並予以針對性治療。