嗜酸性細胞胃腸炎臨床表現多樣，缺乏特異性，症狀與病變的程度、累及的部位相關。它的臨床分型分為三個型：第一、黏膜型，表現為噁心、嘔吐、腹痛、黑便和胃腸道蛋白丟失；二、肌層型，因嗜酸性粒細胞浸潤肌層，可引起胃腸壁增厚，導致幽門梗阻和腸梗阻；三、漿膜型，少見，表現為滲出性腹水，且腹水中含大量的嗜酸性粒細胞，以上三種類型可單獨或混合出現。而對於蛔蟲感染，大部分的病人是沒有症狀的，對於兒童來說，如果蛔蟲的數量過多，可能會造成腸梗阻，表現為噁心、嘔吐、腹痛、腹脹、腹壁可以看到腸型以及排氣、排便的停止。