嗜酸細胞性胃腸炎的發病機制不清楚，多認為是外源性或內源性的變應原，導致的全身或局部變態反應所致。30%-70%患者有家族或個人的食物或藥物過敏史、溼疹、哮喘等病史，有一些如海鮮、牛奶和蜂蜜等也被認為可誘發或加重症狀。蘋果一般來說很少有過敏的，除非極個別的人如果對蘋果過敏，是不能吃蘋果的，對蘋果不過敏就可以吃蘋果。嗜酸性粒細胞胃腸炎要避免攝入其過敏的食物，有助於減緩病情。嗜酸性細胞胃腸炎臨床表現多樣，缺乏特異性，症狀與病變的程度、累及的部位相關。目前在治療上，一個是從飲食中去除任何形式可疑的過敏食物是重要的治療手段，藥物治療方面主要是糖皮質激素。