小兒發生腸炎時可以口服抗生素抗感染治療，比如頭孢拉定、頭孢克洛、阿莫西林等，還可以口服蒙脫石散保護腸黏膜。如果腹瀉次數較多出現脫水徵、電解質紊亂時，還需要口服補液鹽糾正脫水、補充電解質。小兒腸炎時最好不要口服黃連素、PPA之類的止瀉藥物，副作用較大，不適用於兒童，另外兒童腸炎不能口服瀉立停等止瀉藥物。