在急性症狀消退後，病程經過半年以上稱慢性血吸蟲病。慢性血吸蟲性肝病的基本病理改變是蟲卵肉芽腫反應及肝纖維化，嚴重者可形成肝硬化。典型症狀就是腹部極度腫脹，下肢高度水腫。慢性血吸蟲性肝病應首先進行驅蟲治療，可服用吡喹酮消滅成蟲、幼蟲及蟲卵。在改善體質，加強營養的同時，要選擇適當時機，考慮手術治療，可採用幹細胞治療慢性血吸蟲肝病。