結石疼痛常可引發腎絞痛，典型的表現為疼痛劇烈難忍、陣發性的發作，位於腰部或上腹部，沿著輸尿管的行徑放射至同側的腹股溝，還可以累及同側的會陰區或者大腿的內側，位於輸尿管末端的結石常常還可以伴有尿頻、尿急、尿痛等刺激症狀。
對於腎絞痛的緩解，常用的藥物有非甾體類的鎮痛抗炎藥物，例如雙氯芬酸鈉、吲哚美辛、賴氨匹林等，有口服、靜脈注射、肌肉注射以及肛門栓劑等製劑。還有阿片類的強鎮痛藥，這類藥物通常要使用毒麻藥處方，包括嗎啡、杜冷丁、強痛定等。還有解痙藥，又包括M受體阻滯劑，比如阿托品、654-2、黃體酮類的藥物，還有鈣拮抗劑，例如硝苯地平，還有α受體阻滯劑，比如坦索羅辛等。如果這些常用的藥物止疼效果還是不佳，常常需要配合體外衝擊波碎石治療或者輸尿管內放置支架，甚至急診手術的方法。