多數尿路結石需要微創手術治療，來將結石粉碎並排除體外。一小部分比較小的尿路結石，可以選擇自行排石。首先需要根據結石的具體情況，判斷是否滿足排石的適應症。結石排石的適應症包括結石直徑<0.6cm，結石表面光滑，結石以下無尿路梗阻，結石在局部停留少於2周。
胱氨酸結石或者尿酸結石這一類結石都建議去自行排石，並輔助予相應的藥物協助排石，以及生活上多飲水、多活動。如何判斷結石已經排出體外，首先患者自己可以觀察到結石的自行尿出；其次患者臨床症狀消失。最可靠的判斷結石是否排出來的方式是進行復查，如進行B超或者CT等檢查明確。