結石的手術治療一般是分為兩大類，常見的方法如下：
1、輸尿管鏡手術：顧名思義主要是最早用於治療輸尿管的結石，一般從尿道置入，然後沿著輸尿管的內口，將輸尿管鏡放到同側的輸尿管，然後導入激光或者衝擊波等各種能量將結石擊碎，這個手術就做完了。當然現在隨著軟性膀胱鏡的越來越多的臨床使用，也可以用輸尿管鏡來解決腎臟，包括腎盂腎盞的結石；
2、經皮腎鏡手術：經皮腎鏡是通過腎臟表面的體表投影打眼，將腎鏡直接穿入到腎盞以及相鄰的腎盂，然後再進行碎石。
這兩種方法有時候會聯合起來，稱之為叫雙鏡碎石，也就是經皮腎和輸尿管鏡聯合能夠解決絕大多數的複雜尿路結石。