膽總管結石的患者有可能有臨床症狀，也有可能沒有臨床症狀。有臨床症狀的患者主要還是由於結石嵌頓或者繼發感染所造成的主要是表現為上腹部或者右上腹的劇烈疼痛，可以表現為絞痛。疼痛呈陣發性或者持續性，並陣發性加重，可以向右肩背部放射，伴有發熱，噁心嘔吐，部分患者會出現黃疸，嚴重的會表現為小便濃茶色，大便陶土樣，伴有明顯的皮膚瘙癢。體溫可以達到39-40度，伴有寒戰，出現梗阻性化膿性膽管炎的患者，還是有可能出現神經系統症狀和休克