膽管結石的治療分有症狀的膽管結石和無症狀的膽管結石。有症狀的膽管結石需要手術治療，其首選的手術方式是ERCP，是一種微創手術。一般在結石小於2CM的都可以取出。如果結石巨大，就需要經腹腔鏡手術取石。手術過程比較複雜，需要三鏡聯合或者兩鏡聯合手術。無症狀的膽管結石，其治療方法決定於結石的大小。小的無症狀膽管結石不用治療，只需定期複查。超過3CM時，就需要手術治療，手術方式與有症狀膽管結石類似。