膽管結石包括肝內膽管結石和肝外膽管結石，無論是何種部位的膽管結石都容易造成膽管炎的發作。而肝內膽管結石還容易引起膽管狹窄以及肝臟萎縮，甚至引起膽管細胞性肝癌。而肝外膽管結石還有可能造成急性梗阻性化膿性膽管炎，這是非常嚴重的一種急腹症，容易引起全身炎症反應綜合徵，造成多器官功能衰竭危及生命。當然肝外膽管結石也可以造成膽管癌變，也就是常說的膽管癌。無論是膽管細胞性肝癌還是膽管都是惡性程度非常高的消化系統腫瘤，嚴重影響患者生存期，5年生存率不適合過30%。