腦血栓形成的急性期指的是發病之後的兩週之內，急性期的治療，如果發病時間不超過4.5小時，可以採用靜脈溶栓的方法。靜脈溶栓是目前治療急性腦血栓最有效的方法，它可以明顯減輕病人的殘疾程度。如果超過4.5小時，但是不超過24小時，在醫生的綜合評估下，假如病人能夠滿足某些條件也可以採取動脈取栓的方法，動脈取栓同樣可以取得良好的療效。
除靜脈溶栓和動脈取栓之外，其它的治療也非常的重要，比如抗血小板聚集治療，常用的藥物是阿司匹林和氯吡格雷，有的時候根據病情需要還要採取雙重抗血小板治療的方法。還要進行強化降脂治療，這個也非常的重要，它能夠減輕病人的復發，主要採用的藥物是他汀類的降脂藥。假如病人病情穩定之後，還要啟動降血壓的治療，要把血壓維持在比較合適的水平，之後還可以進行康復的治療。在腦血栓的治療當中，抗血小板治療、抗脂治療和降壓治療是最主要的三個方面。