鞍上生殖細胞瘤手術切除難度大，術後併發症也較多。手術的主要目的是肯定腫瘤性質，明確診斷，術後應常規放射治療，為防止腦脊液的播散轉移。
一、藥物治療
長春新鹼、卡鉑、甲氨蝶呤：此類腫瘤對化療也很敏感，目前多與放療的聯合應用來減少放療的劑量和照射範圍，以防止放療造成兒童發育停滯等副作用，此為常用化療藥物。
二、手術治療
開顱手術或經口鼻蝶竇手術進行切除：手術的主要目的是明確診斷並確定腫瘤性質，同時減輕腫瘤對視神經和視交叉的壓迫，以改善或保護視力，解除腦脊液循環的梗阻。
三、放射治療
可採用普通放射治療或立體定向放射治療，化療可提升放療效果，防止大劑量放療造成兒童和少年的生長發育障礙和學習障礙。
四、中醫治療
採用傳統中藥蟲草、豬苓、明黨參、桑寄生、青陽參、香菇、紅豆蔻、山萸肉、木瓜、仙茅、制半夏、補骨脂、獨活、石菖蒲、仙鶴草、大薊、山奈、枸杞子、薏苡仁、地榆、白前、丹皮、射干、當歸、土鱉蟲、青黛、肉桂、制鱉甲、連翹、紫草、桃仁、三七等配合治療，見效快，療效確切。這些藥物配合使用能在短期內縮小腫塊、控制轉移擴散、減輕痛苦、穩定病情、延長生存期，提高生存質量。這些傳統中藥配合使用可以有效控制癌細胞轉移擴散，能夠增強機體免疫功能以達到抑制癌細胞生長，增強機體免疫力。